當深圳企業需要辦理注銷手續時，除了營業執照注銷外，還涉及到債權債務問題的處理。在注銷前，企業應首先召開股東會議或股東代表會議，通過決議解散企業，并委派清算組成員進行清算工作。清算組成員應當依法召集債權人和債務人進行債權債務的確認、清償和處理，編制清算方案并報批后實施。在上述工作完成后，才能進行營業執照注銷。

深圳的營業執照注銷流程包括解散企業、清算、稅務注銷、銀行注銷、注銷營業執照以及社保注銷。企業可以在深圳市工商行政管理局網站上下載《深圳市企業注銷申請表》，并準備企業法人營業執照原件及復印件、稅務注銷證明原件及復印件、開戶銀行注銷證明原件及復印件、清算方案等資料，持資料和申請表到深圳市工商行政管理局窗口進行現場審核和辦理，或選擇委托相關專業服務機構代理辦理。

需要注意的是，注銷時間較長。一般情況下，需要2-5個月以上的時間，具體時間取決于注銷類型（簡易/一般）和企業情況。注銷費用也不便宜，大約在2000-5000元之間，具體還要根據公司情況而定。不過，不管費用高低，如果企業不做好注銷準備，放任不管，可能會導致公司被列入經營異常，對企業的法人也會產生不良影響。因此，企業應及時了解相關注銷手續和流程，避免不必要的麻煩和經濟損失。