如果一家深圳公司需要辦理注銷手續，應該在深圳市工商行政管理局辦理企業注銷。根據注銷流程，企業應先召開股東會或者股東代表會議，通過決議解散企業，委派清算組成員進行清算工作。清算組成員應當依法召集債權人和債務人進行債權債務的確認、清償和處理，編制清算方案并報批后實施。清算后，清算組成員到所屬稅務機關辦理稅務注銷手續，領取稅務注銷證明，并到企業開戶銀行注銷企業銀行賬戶。

接下來，持清算組成員的身份證明、稅務注銷證明、企業法人營業執照、開戶銀行注銷證明和注銷申請表等資料到深圳市工商行政管理局辦理企業注銷。同時，企業還要到所屬社會保險機構辦理社保注銷手續。

辦理注銷手續有三種方式，一是自己到深圳市工商行政管理局進行現場審核和辦理，二是委托相關服務機構代理辦理，三是在線下載《深圳市企業注銷申請表》等資料并提交審核。

注銷公司的時間根據情況而異。如果公司沒有任何異常，無稅務欠款，未開展經營活動，無債權債務的有限公司，可以走簡易注銷流程，一般需要20個工作日。一般注銷流程及時間就會相對長些，因為注銷需要清算組備案公告、債權人公告45天，稅務注銷，清稅證明。公告期到后才能注銷工商、銀行等等。注銷費用一般在2000-5000元之間，具體還要看公司的情況。如果不注銷，公司就會被列入經營異常，法人也可能受到影響。雖然注銷手續費用不便宜，但及時注銷閑置公司，可以避免后續的不必要麻煩，尤其是對于有經營計劃的企業，及時注銷后，可以省去一部分稅費和其他費用，還能降低日常維護成本。