作為一個企業，在經營過程中可能會面臨注銷的情況。注銷并不是一步簡單的事情，涉及到多個部門和復雜的程序。以下是一些方法可以幫助深圳的企業避免注銷操作中的罰款問題：

1.提前咨詢相關機構：在決定注銷公司之前，建議提前咨詢相關的機構或專業機構，以了解注銷程序和相關規定。熟悉了這些規定，可以避免不必要的罰款或其他費用。

2.及時處理相關事宜：一旦決定注銷企業，請及時處理相關事宜，避免耽誤時間，處理不及時出現延遲等問題，帶來不必要的費用，加重負擔。

3.遵循相關規定：在注銷過程中，必須遵循相關規定，例如清算流程等。否則可能面臨一定的罰款。因此，為了避免這種情況，應認真研究有關規定，保持對流程和法規的了解。

4.查看注銷費用：注銷企業需要支付一定的費用，這些費用可能會因公司的情況而不同。在注銷前，可以先了解相關費用，防止被不必要的罰款補充財務負擔。

5.找到合適的代理機構：企業注銷具有一定的復雜性和繁瑣性。如果您不確定如何操作，請找到一家專業的代理機構，他們有專業的知識和經驗，可以指導您如何避免罰款問題。

總之，深圳企業在注銷公司時，應該遵守相關程序和規定，注意時間和費用的計算，以便避免不必要的罰款問題，同時可以尋求專業的代理機構的幫助，來提供更好的服務和支持。