深圳公司注銷代理機構并不是一件輕松的事情。除非公司非常簡單且沒有流水，否則注銷公司的費用極高。這主要有幾個原因。

首先，注銷公司的流程非常復雜繁瑣。整個注銷過程需要經過工商局備案、國稅局申請注銷、地稅局申請注銷、代碼注銷等多個步驟，時間至少需要兩個月到六個月不等，而分公司注銷的時間更長。此外，注銷公司需要在各方面提交大量資料，包括賬簿、憑證、財務會計報表等。如果由不熟悉流程的新手來處理，浪費的時間和機會成本更高。

其次，注銷公司需要來回多次并且需準備很多的資料。一般需要走10次國稅局、10次地稅局、4-5次工商局和3-4次銀行才能完成注銷。稅務局還會對企業的納稅風險進行評估，看是否存在異常納稅等情況。由于一些原因，如租金發票等未打開，則注銷手續和成本將增加。

此外，不注銷公司將會受到很多限制。涉及到公司法定代表人和股東的事件都將會受到限制，如工商局黑名單中不辦理公司、法定代表人不能領取養老保險、法定代表人不能貸款買房或移民、國稅、地稅不能在稅務部門登記、公司會計信息將予以公示和管理等。如果涉及欠稅，企業法定代表人將被禁止出境。如果長期不報稅，發票將被鎖定。而如果以后要取消，則會面臨工商局和稅務局的罰款和滯納金。

總之，對于深圳的公司來說，如何順利注銷代理機構是一件非常復雜和昂貴的事情。因此，在做出決定之前一定要認真思考和咨詢相關專業人士的意見，以避免不必要的麻煩和損失。