深圳公司CA證書是企業在進行網絡交易和政務處理時必備的一種數字證書。但是有些企業可能由于各種原因需要注銷在工商局注冊的CA證書，這個過程并不簡單。首先要通過工商局備案，然后需要申請注銷國稅局和地稅局的稅務登記，接著是銀行對公賬戶注銷和工商局提交注銷文件等繁瑣步驟，流程復雜，時間長達2個月至6個月不等。如果公司出現一些嚴重問題，需要一年才能注銷。

注銷公司的管理流程相當復雜繁瑣，需要來回多次提交注銷資料，其中涉及到各個稅務機構，需要分別提交注銷申請，整個的處理過程需要長時間、高效率和熟練的操作。如果由不懂流程的人來處理，往往需要花更多的時間和精力，甚至可能會產生額外的成本和罰款。

另外，注銷公司還需要解決一些納稅問題，例如公司租金發票沒有開具、未找到公司的租賃合同、偷稅漏稅等等，都可能增加注銷手續的繁瑣程度和成本。

如果不注銷公司，可能會面臨許多負面影響，最嚴重的后果是公司信用污點，法定代表人和股東在以后處理相關事項時將受到各種限制。例如，工商局不辦理公司相關事宜、法定代表人不能領取養老保險、不能貸款買房或移民等等。此外，涉及欠稅、長期不報稅、不申報稅務等情況，會被稅務部門公示和管理，企業法定代表人可能被禁止出境、發票可能會被鎖定、工商征信網進入異常經營名單等等。

總之，注銷深圳公司CA證書不是一件簡單的事情，需要耐心、時間和精力，同時需要了解注銷流程，并盡可能減少所涉及的問題及其成本。企業應該及時注銷CA證書，避免造成影響及不必要的麻煩。