在深圳注冊的公司要辦理記賬，一般來說，小規模納稅人和普通納稅人的費用存在一定差別。小規模納稅人的辦理時間相對較短，而普通納稅人則需要更多的時間和復雜的程序。小規模納稅人的標準收費約為2000元/年，而普通納稅人則要在5000-6000元之間。

如果是小規模納稅人，我們建議找會計核算。會計費用不算太高，每個月一般在300-600元之間，視公司規模和所在地區而有所不同。如果公司收入較高，可以考慮聘請全職會計，但要注意保留公司收入的所有賬單，按時報賬，核對銀行賬戶，避免被稅務機關處罰。

如果是普通納稅人，記賬報稅程序比較復雜，代理記賬分為幾種情況，費用也因此不同。如果只是提供記賬、會計報稅服務，一般每個月500元-600元；若需要幫助企業申請發票、開具、進行認證抵扣業務，則每月1000元-1200元；如果需要進行稅務籌劃，則費用會更高，每月1500元-2000元。

需要注意的是，記賬公司通常還提供工商注冊、年檢、驗資等業務，需要額外收費。在選擇記賬公司的時候，除了價格是否透明外，還要注意其服務質量和信譽度。企業可通過咨詢其他同行業公司或線上評價來進行判斷。

總結起來，在深圳注冊的公司，記賬代理辦理時間和費用因企業規模及納稅類別的不同而有所差異，建議在選擇代理記賬公司時要注意選擇規模適合、價格透明、服務穩定的公司。