對于深圳注冊的公司，代理記賬的費用也有所不同。小額公司的記賬報稅費用一年約為2200元。這會涵蓋年度賬目整理、賬簿歸集、財務報表、納稅申報、稅務登記等基礎服務。如果需要更復雜的業務，如增值稅遞延稅款、跨境電商稅務籌劃等，則會另行收費。另外，一些記賬公司可能會根據企業的具體情況，為其量身定制服務，收取不同的費用。

值得注意的是，代理記賬的費用并不是越高越好。一些小型企業為了省錢，可能會選擇低價服務，但由于專業技術不足，有可能導致賬目混亂、漏報稅款等問題，最終被稅務機關罰款。因此，選擇正規的記賬公司并掌握自己企業的財務狀況是非常重要的。

綜上所述，深圳公司代理記賬收費參差不齊，需要企業結合自身情況選擇適合的服務商和服務方案。選擇合適的記賬服務能夠為企業提供及時的財務管理支持，使企業財務趨于規范化、透明化，為企業的發展提供更加有力的保障。