深圳注冊公司流程并不復雜，其中醫療器械公司注冊也是如此。在進行注冊前，需要準備如下材料：

1、公司設立登記申請書；

2、公司章程；

3、法定代表人身份證及其復印件；

4、股東身份證及其復印件；

5、住所使用證明。

第一步：核名，該步驟需要去工商局進行辦理，核名費用為0元。核名通過后，可以選擇在線填寫公司設立登記申請書，或者前往工商局窗口進行填寫。

第二步：制定公司章程，公司章程是對公司治理結構、業務范圍等方面的規定，應該根據實際情況進行制定。

第三步：繳納注冊資本，醫療器械公司的注冊資本應不少于100萬元人民幣。

第四步：在工商局進行登記備案，該步驟需要提交上述所需材料。登記備案完成后，可前往銀行進行開戶。

第五步：辦理營業執照，收到工商局核發的營業執照后，醫療器械公司正式成立。

第六步：刻制公章及發票專用章。

第七步：進行做賬報稅，根據公司經營情況選擇對應的做賬報稅服務。

最后，醫療器械公司需要考慮到專業要求的審批、備案等方面，如需經營需要取得相應的許可證。整個醫療器械公司注冊過程中，費用主要包括核名和刻章費用，做賬報稅和銀行賬戶等都需要根據實際情況進行選擇和辦理。