深圳自貿區是深圳市政府借鑒國際先進經驗打造的特殊經濟區，為企業提供更加便利的創業、發展環境。相較于傳統注冊公司的流程，深圳自貿區注冊公司更為簡單。以下是深圳自貿區公司注冊相關指南：

1. 公司名稱核名

公司名稱的核名工作由市場監管部門完成，根據注冊局提供的名稱，核名通過后將頒發一張核名通知書。通常來說核名是免費的，但有的代理公司可能會收取一定的手續費用。

2. 商務掛靠地址

商務掛靠地址是在公司注冊時需要提供的地址，通常需繳納一定費用。在深圳自貿區注冊公司，通常需要選擇當地的企業服務商提供的商務掛靠服務。商務掛靠地址的費用也是由服務商收取。

3. 公司章程

公司章程是公司運營的基本法規，需要由公司股東共同制定并簽署。在深圳自貿區注冊公司，公司章程的制定不需要繳納費用。

4. 法人股東證件

在深圳自貿區注冊公司，申請人需要提交法人和股東的身份證明等相關證件。此外，注冊公司還需要提供公司經營活動所需的營業執照、組織機構代碼證、稅務登記證等相關證件。

5. 刻章

在深圳自貿區注冊公司后，需要進行公司章的刻制。在深圳注冊公司，刻章是免費的。當然，如果在公司運營期間需要更換章，需要自行承擔相應費用。

6. 做賬報稅

做賬報稅是公司運營過程中必不可少的一項工作。在深圳注冊公司，需要選擇專業的會計師事務所代辦。做賬報稅的收費按照具體公司情況而定，收費標準在2000元至6000元之間左右。

7. 銀行開戶

在深圳自貿區注冊公司后，需要去銀行開立企業銀行賬戶。在深圳注冊公司開銀行賬戶是免費的，但需要自己親自處理，事務繁瑣。如果找代理公司幫忙，代理費用也是需要自行承擔。

總的來說，深圳自貿區注冊公司相比其他地區更加便利簡潔，具體需要承擔的費用也比較少。在進行公司注冊前，建議了解清楚相關材料和費用，并在選擇代辦公司時要仔細分析。同時，選擇專業的會計師事務所代辦做賬報稅，為公司的長期發展提供有力保障。