深圳注冊公司的過程并不是非常復雜，但是在辦理公司機構變更時，需要注意一些事項。首先，根據相關法律法規，公司機構變更需要經過股東會或董事會的決議，并進行公告，然后向工商部門提交申請材料，等待審批和領取新的營業執照。

其次，辦理公司機構變更需要提供一些證明材料，如公司設立登記申請書、公司章程、法人股東資格證明、代理人身份證及其復印件、住所使用證明等。這些材料需要提前準備好，并確保其真實性和有效性，以避免審批過程中出現問題。

此外，辦理公司機構變更還需要考慮一些費用問題。如有需要換章，需要自行支付刻章費用，一般在200-500元之間。銀行開戶需要花費時間和精力，代辦公司可以幫忙辦理，但會收取跑腿費。銀行每年還會收取賬戶管理費，具體定價標準不同，一般幾百元不等。

還需要注意的是，變更后的公司機構和業務范圍需要與原來的保持一致，否則需要重新進行公司設立登記。

總之，辦理公司機構變更的流程與注冊公司的流程類似，但是需要特別注意證明材料的真實性和有效性，并且需要對費用問題有所了解。只有確保了以上問題，才能順利辦理公司機構變更。