深圳注冊公司必須要擁有電子證書。電子證書是指一種用于標識網絡上公民、法人和政府機關的身份的數字證書，它采用公鑰密碼學技術，通過電子手寫簽名、電子印章等安全技術來保障身份認證、信息訪問和信息傳輸的安全性。在公司注冊的過程中，電子證書扮演著非常重要的角色。

首先，電子證書是公司注冊的必要條件。根據《公司法》及其實施條例的規定，公司的章程和股東會議決議必須采用電子簽名。在制定這些文件時，需要用到電子證書的私鑰進行簽名。因此，如果沒有電子證書，公司的注冊就無法完成。

其次，電子證書還起到了加密通信的作用。在公司的日常經營中，很多涉及機密信息的文件需要傳輸。這時，如果不進行加密處理就存在泄密的危險。通過使用電子證書，可以對這些文件進行加密，保障信息的安全性。

最后，電子證書還是公司進行電子商務的前提。在網絡上開展業務或者辦理一些業務時，需要進行身份驗證。如果沒有電子證書，就無法進行身份驗證，從而無法進行電子商務交易。

總的來說，在深圳注冊公司的過程中，電子證書是必不可少的。它不僅可以保障注冊的順利進行，還可以在公司的日常經營中發揮重要作用。因此，對于想要注冊公司的人士來說，及早申請電子證書是非常重要的。